Biuro pracuje w KSeF na podstawie uprawnień nadanych przez klientów. Na tej podstawie automatyzacja regularnie pobiera faktury zakupowe i sprzedażowe każdego klienta, zapisuje je w jego folderze i dopisuje do zestawienia dokumentów za dany miesiąc. Zespół nie musi logować się do KSeF dla każdego klienta osobno.
Faktury z KSeF trafiają do tego samego miejsca co dokumenty spoza systemu: paragony, faktury zagraniczne i rachunki. Dzięki temu księgowy widzi pełny obraz klienta w jednym zestawieniu, a system może wskazać np. fakturę przesłaną przez klienta mailem, która jest już w KSeF.
Automatyzacja pilnuje też organizacji: listy klientów z aktywnymi uprawnieniami, informacji o problemach z pobieraniem i statusu dokumentów klienta w danym miesiącu. Jeśli program księgowy biura sam pobiera faktury z KSeF, nie dublujemy tego, tylko uzupełniamy to, czego brakuje.